公司法人缴纳社保的程序如下：
1、首先在企业所在辖区开立企业社保账户；
2、将参保员工的社会保障关系转入企业账户；
3、社保缴费首月打印社保缴费明细，明细包括员工姓名、身份证号码、缴费基数等；
4、办理同城委托扣缴社保手，这是到企业开户银行办理；
5、以后每月只需向社保提交参保人员增减表。
公司法人也是属于公司员工中一员，所以也要交社保，对于单位员工，通常都是以单位名义办理社保缴纳业务。
一、灵活就业人员身份是否需办理减员
灵活就业人员身份无需办理减员。
只有员工离职，才需要单位人事部门员工，去社保中心办理离职员工减员手续，其后离职员工可以灵活就业人员身份继续缴费。
企业员工参保人员的增减变动要在每月的月初到15日内到养老保险中心办理手续。
办理参保人员减少要带身份证和解除劳动关系证明材料，单位填写增加变动表，到区养老保险中心的大厅办理手续。超过15日就不再办理变动了。只能办理丧葬费和其他业务。
社保减员生效时间是25日前是当月生效，25日后下个月生效员工离职应在离职当月及时办理社保减员，减员成功的次月不再产生社保应征数据。
办理社保增减员的方法如下：
1、准备好社会保险减员表。
2、盖章减员表打印出来后，要盖上单位的公章；
2、人社局官网备案。一般社保局会有一个窗口是专门用来做劳动用工备案盖章的。但前提是要在系统里面做好，可以进入人力资源保障网；
4、劳动用工备案处盖章。在系统做好后，就把减员表和相应资料带过去办理；
5、征缴科进行当月保险申报。委托了自动划转业务的单位或企业，一般最好在当月的15号之前要进行申报，不然到15号过后，不管申报没申报，都会自动划转钱进入社保账户，所以要把握好时间节点。